Пятый сезон «Гинтамы» начинается с того, что привычный хаос в Эдо достигает точки кипения. Казалось бы, банда Ёродзуя снова втянута в абсурдные разборки: то нужно спасать город от нашествия гигантских тараканов, то участвовать в межгалактическом конкурсе красоты, где главный приз — годовой запас майонеза. Но за этой привычной клоунадой всё отчётливее проступает трещина в фундаменте мира. Амато, некогда побеждённые, начинают проявлять недовольство политикой сёгуната, а в тенях всё чаще мелькают фигуры таинственных ниндзя и бывших военачальников. Гинтоки, который обычно решает всё ударом деревянного меча и шуткой ниже пояса, вдруг сталкивается с тем, что его прошлое перестаёт быть просто пьяными байками. Воспоминания о войне, о павших товарищах и о том, кем он был до того, как стал вечным должником и любителем журналов для взрослых, начинают преследовать его с новой силой.
Второй акт сезона резко меняет тональность. То, что начиналось как очередное безумное приключение с участием Кагуры, которая пытается вырастить арбуз размером с дом, и Синпати, который случайно становится звездой сомнительного телешоу, оборачивается цепью событий, ведущих к гражданской войне. Сёгунат, ослабленный коррупцией и внешним давлением, теряет контроль. Старые враги становятся временными союзниками, а те, кого считали друзьями, предают. Гинтоки вынужден сделать невозможный выбор: остаться в стороне, сохранив остатки своей беззаботной жизни, или снова взять в руки меч, зная, что на этот раз он может не вернуться. Финал сезона — это не просто битва. Это момент, когда Гинтоки, стоя на руинах разрушенного храма, смотрит на горящее небо и понимает: шутки кончились. Эдо больше не будет прежним, и чтобы защитить тех, кто ему дорог, ему придётся стать тем, кого он так долго пытался забыть — самураем, который не боится испачкать руки в крови.