Война Святого Грааля, тайный ритуал, где семь магов сражаются насмерть, призывая легендарных героев, была украдена. Клан Искусств, одна из трех великих семей основателей, похитила сам ритуал, вырвав его из рук Ассоциации магов. Их цель — не просто получить артефакт, а навязать миру свою волю, используя Грааль как инструмент. Однако Ассоциация не собирается уступать. Вместо того чтобы уничтожить похитителей, они решают сыграть в их же игру, создав параллельную Войну. Так рождается Великий Заказ Святого Грааля — беспрецедентное событие, где вместо семи слуг сражаются четырнадцать, разделенных на две армии: Красную, подконтрольную Ассоциации, и Черную, верную клану Искусств. Каждая сторона призывает по семь героев, и битва разворачивается не в тайне, а в открытую, на территории замка-крепости Трифа, ставшего полем боя.
Среди этого хаоса оказывается юноша по имени Сиро Котомине, бывший священник, которому суждено стать мастером класса Сейбер. Но его Сейбер — не обычный герой. Это Жанна д’Арк, Святая Дева Орлеана, призванная не как участница, а как беспристрастный судья, Руллер, чья задача — не дать войне выйти из-под контроля. Однако судьба играет злую шутку: Жанна оказывается втянутой в конфликт, который разрывает ее сердце. На стороне Черной армии сражается ее искаженное отражение — Жанна Альтер, воплощение ненависти и гнева, рожденная из проклятия Грааля. Пока армии сталкиваются в эпических битвах, где рыцари Круглого стола сражаются против вампиров и античных героев, Сиро и Жанна пытаются найти истинный смысл войны. Им предстоит понять, что за кулисами грандиозного сражения скрывается куда более личная и трагическая цель: желание одного человека переписать саму историю, воскресив утраченную любовь, и для этого он готов пожертвовать всем миром. Война перестает быть битвой за артефакт, превращаясь в столкновение идеалов, где каждый герой и мастер должны сделать выбор между долгом и собственным сердцем.
