Третий сезон «Повелителя» начинается с того, что Аинз Оал Гоун, теперь уже признанный правитель подземного царства Назарик, сталкивается с последствиями собственного величия. После уничтожения армии королевства Ре-Эстиз и гибели Газафа Строноффа, его слава расползается по всему континенту, привлекая внимание не только людей, но и могущественных сущностей. В то время как Аинз пытается сохранить маску непогрешимого владыки, внутри него нарастает тревога: он боится, что его истинная сущность — обычного парня из другого мира — будет раскрыта. Чтобы укрепить власть и найти новые источники информации, он решает отправить эмиссаров в Империю Бахут, где правит амбициозный император Джиркнив, который подозревает в Аинзе не просто человека, а нечто большее. Параллельно в Назарике зреет внутренний конфликт: верховные слуги, такие как Альбедо и Демиург, начинают действовать по собственной инициативе, интерпретируя приказы повелителя в угоду своим амбициозным планам, что приводит к жестоким экспериментам над людьми в тайных подземельях.
Вторая половина сезона резко меняет тон, когда в сюжет врывается вторжение из другого мира. Армия Королевства Ре-Эстиз, ведомая отчаянным принцем Занбаром, решает нанести последний удар по Назарику, но их атака оборачивается кровавой бойней. Аинз, используя заклинание «Падение небес», уничтожает целую армию одним махом, демонстрируя свою абсолютную силу, но это лишь разжигает аппетит его подчиненных. В финале раскрывается истинный масштаб угрозы: в мир приходит гильдия «Владыки Небес» — группа игроков из прошлого, которые когда-то враждовали с Аинзом. Они захватывают город Э-Рантель, и Аинз, наконец, получает шанс сразиться с равным противником. Однако битва оборачивается неожиданным финалом: выясняется, что «Владыки Небес» — всего лишь марионетки, управляемые таинственным существом, которое знает о происхождении Аинза больше, чем он сам. Сезон заканчивается на тревожной ноте: повелитель понимает, что его игра в бога может привести к пробуждению сил, способных уничтожить не только Назарик, но и весь этот мир.
