Третий сезон «Моей геройской академии» начинается с того, что Изуку Мидория и его друзья из класса 1-А отправляются в летний лагерь для усиления своих причуд. Тренировки под руководством профессиональных героев должны подготовить их к предстоящему фестивалю и дальнейшим испытаниям. Однако идиллия рушится, когда Лига злодеев, ведомая безумным Стайном и загадочным Все За Одного, устраивает внезапную атаку на лагерь. Их цель — похитить Кацуки Бакуго, чья взрывная причуда и неукротимый дух делают его идеальной мишенью для вербовки. В хаосе сражения ученики вынуждены проявить всё, чему научились, но силы неравны, и злодеям удаётся увести Бакуго. Это событие становится переломным моментом: герои понимают, что враг стал действовать гораздо смелее и организованнее, а безопасность учеников больше не гарантирована даже под присмотром профессионалов.
Вторая половина сезона посвящена отчаянной попытке спасти Бакуго и предотвратить катастрофу. Изуку, Тодороки, Киришима и Яойорозу, нарушив приказы, самостоятельно проникают в логово Лиги злодеев, чтобы вытащить товарища. Там они сталкиваются с новыми могущественными противниками, включая деформированного гиганта Мускула и психопата Тогу. Параллельно Все За Одного решает лично вмешаться в ход событий, чтобы устранить Символ Мира — Всемогущего. Финальная битва между ними становится кульминацией сезона: израненный, теряющий остатки силы Всемогущий сражается не на жизнь, а на смерть, чтобы защитить учеников и доказать, что геройство не исчезает вместе с причудой. Изуку, наблюдая за этим, осознаёт истинную цену силы и ответственности. Сезон заканчивается на горькой ноте: Всемогущий теряет свою причуду, но спасает Бакуго, который, наконец, признаёт, что его похищение было спланировано из-за его слабости и гордыни. Мир героев меняется навсегда, оставляя новое поколение перед лицом ещё более опасного будущего.
