Второй сезон «Оммёдзи: История Хэйан» начинается с того, что хрупкое равновесие между миром людей и духов оказывается под угрозой. После событий первого сезона Минамото-но Хиромаса, поглощенный жаждой власти и одержимый идеей подчинить себе силы тьмы, решается на отчаянный шаг. Он вступает в сговор с могущественным демоном, который обещает ему контроль над столицей в обмен на освобождение древнего зла, запечатанного веками. Хиромаса, используя свои связи при дворе и остатки влияния клана Минамото, начинает тайно собирать артефакты и проводить ритуалы, чтобы разорвать печать. Это приводит к тому, что по всему Хэйан-кё начинают происходить странные и пугающие события: люди сходят с ума, видят кошмары наяву, а в городе появляются все более агрессивные и необычные ёкаи. Сэймэй и Хиромаса, которые после прошлых потрясений пытались наладить хрупкое перемирие, вновь оказываются по разные стороны баррикад. Сэймэй чувствует, что за этими беспорядками стоит нечто большее, чем просто происки недовольных духов, и начинает собственное расследование, которое приводит его к заброшенному храму на окраине столицы.
Тем временем Цубаки, пытаясь найти свое место в мире, где её способности видят духов то проклятием, то даром, сталкивается с таинственным странником. Этот человек, представившийся простым монахом, на самом деле оказывается одним из древних хранителей равновесия, который веками следил за печатью. Он раскрывает Цубаки страшную правду: если демон, которого пытается освободить Хиромаса, вырвется на свободу, он не просто уничтожит столицу, а исказит саму реальность, смешав миры живых и мертвых. Цубаки оказывается перед выбором: остаться в стороне или помочь Сэймэю, рискуя собственной жизнью. Сэймэй, понимая, что в одиночку ему не справиться с пробудившимся древним злом, вынужден искать союзников среди тех, кого раньше считал врагами. Финальная битва разворачивается не только на физическом плане, но и в мире духов, где Сэймэй вступает в ментальную дуэль с демоном, пытаясь переиграть его хитростью и знанием древних законов. Цена поражения — не просто смерть, а вечное проклятие для всего Хэйан-кё, и каждый из героев должен сделать решающий шаг, чтобы спасти не только себя, но и будущее всей Японии.
