Мир изменился. Огромные участки суши ушли под воду, и то, что раньше было континентами, превратилось в бескрайнее синее море, усеянное редкими островами. Цивилизация выживает за счёт добычи древних ресурсов, скрытых в глубинах, и управления гигантскими механизмами, оставшимися от прежней эпохи. В этом мире живёт Канна, девушка-механик с одного из таких островов. Она талантлива, но её жизнь переворачивается, когда на берег выбрасывает загадочного юношу по имени Агито. Он — последний выживший из легендарного народа Магмел, который обладал способностью управлять энергией самой планеты. Агито не помнит своего прошлого, но его появление привлекает внимание военной фракции, жаждущей заполучить силу Магмел для создания абсолютного оружия. Канна, рискуя всем, решает помочь ему разобраться в том, кто он такой, и защитить его от охотников.
Вместе они отправляются в опасное путешествие через бескрайние воды, где старые карты не работают, а на дне океана скрываются руины погибших городов. По пути к ним присоединяются странные союзники: пираты, учёные и такие же изгои, как они сами. Агито постепенно вспоминает, что его народ не просто исчез — их уничтожила собственная гордыня и жажда контроля над стихией. Теперь та же сила пробуждается в нём, грозя повторить катастрофу. Канна понимает, что спасти Агито — значит не дать миру окончательно уйти под воду. Но цена этого спасения может оказаться слишком высокой: чтобы остановить древнее зло, придётся пожертвовать тем единственным, что связывает их с прошлым. В финале герои сталкиваются с выбором между спасением одного человека и будущим всего человечества, и ответ на этот вопрос лежит не в технологиях, а в том, на что способно сердце.