Небо над портовым городом Камакура всегда кажется слишком близким, словно давит на плечи. Для старшеклассницы Соры это ощущение стало привычным — она потеряла отца в море год назад, и с тех пор её жизнь застыла между двумя стихиями. Она не может уйти в воду, боясь воспоминаний, но и небо не даёт ей покоя, напоминая о пустоте. Всё меняется, когда она случайно встречает странного парня по имени Наоки, который утверждает, что слышит голоса утонувших кораблей. Он работает в заброшенном маяке, где собирает обломки судов и записывает их истории. Сора сначала считает его чудаком, но её притягивает его одержимость — он единственный, кто не пытается её утешить банальными фразами. Вместе они начинают разбирать старые записи её отца, который был морским биологом, и находят странные координаты, ведущие к подводному разлому, где, по слухам, исчезают корабли без следа.
Погружаясь в тайну, Сора и Наоки сталкиваются с местными рыбаками, которые боятся этого места, и с корпорацией, планирующей построить там глубоководный рудник. Но главное — они обнаруживают, что разлом не просто поглощает суда, а хранит в себе эхо всех, кто погиб в этих водах. Наоки слышит их отчётливо, и однажды среди голосов Сора узнаёт шёпот отца. Чтобы понять, что он пытался сказать, им придётся спуститься на дно — не физически, а через воспоминания и страхи, которые каждый носит в себе. Сора учится дышать под водой, не захлёбываясь прошлым, а Наоки перестаёт бояться, что его дар — это проклятие. В финале они не находят сокровищ или ответов на все вопросы, но понимают: небо и море не разделяют людей, а соединяют их в едином цикле прощания и надежды.
